基因突变已被证实是癌症诊断、产前早筛、传染病耐药性检测中的重要生物标志物。对其进行精准检测将有利于辅助癌症的诊断、伴随治疗、靶向用药和预后评估。然而,高浓度的具有相似序列的野生型对微量肿瘤突变的超灵敏检测造成了严重的干扰,致使其精准检测困难。因此,开发超灵敏的突变检测探针,在临床样品中实现微量肿瘤突变的检测具有重要的临床意义和科学价值。
针对上述挑战,李峰教授团队基于在“热力学指导诊断探针精准设计”方向上的研究基础(J. Am. Chem. Soc. 2023, 145, 2750; Nat. Commun. 2023, 14, 4248; Nat. Commun. 2022, 13, 4667; J. Am. Chem. Soc. 2021, 143, 13655; Nat. Commun. 2020, 11, 5473; Angew. Chem. Int. Ed. 2020, 59, 22617),首次提出了错配介导DNA组装的探针设计策略,实现了低至0.01%的肿瘤突变的超灵敏检测(如图)。通过与华西医院李为民教授、应斌武教授团队合作,进一步实现了肺癌组织、血液、胸腔积液等临床实际样品中肿瘤突变的精准检测,相关成果近期发表于JACS。
图1.基于错配介导DNA组装的探针设计
该研究以“Mismatch-guided deoxyribonucleic acid assembly enables ultrasensitive and multiplex detection of low-allele-fraction variants in clinical samples”为题发表在Journal of the American Chemical Society上,第一作者是四川大学化学学院博士研究生黄丹,华西呼吸健康研究所邓慧博士和华西检验科周娟博士。化学学院李峰教授、华西医院李为民教授、应斌武教授为共同通讯作者。